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 ORIGENICS概要
 
標的遺伝子の探索から設計・評価までを
ワンストップで
バイオ研究者の“煩雑な情報収集と比較作業”を
自動化・高速化するプラットフォーム
ORIGENICSは、核酸医薬の開発過程で不可欠な標的遺伝子解析・配列比較・安全性評価を、統合的にサポートするツール群です。複数のデータベース・解析ソフトウェアを連携し、研究者が本質的な設計思考に集中できる環境を提供します。
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 ORIGENICSでできること


標的遺伝子の転写産物を比較

標的遺伝子の転写産物情報をNCBI datasets APIを利用して取得し、転写産物同士を比較して共通/異なる領域で核酸医薬品を設計することができます。


マルチプルアライメントによる比較

ClustalOmegaを用いたマルチプルアライメントにより、複数の転写産物間で共通した領域で核酸医薬品を設計することができます。


二次構造予測・変異を考慮した核酸医薬品設計

CONTRAfoldを用いた標的部位の二次構造予測結果や、ClinVarから収集した変異情報を考慮してsiRNA、アンチセンス等の核酸医薬品を設計することができます。
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 ORIGENICSの特徴

設計の判断に必要なすべての情報を
一つの環境で可視化・統合


効果的な部位を瞬時に選択

転写産物やオルソログの共通する部位、異なる部位を瞬時に計算して期待する効果を得られる部位を選択することができます。

使いやすく直感的なUI

グラフやマップで直感的にわかりやすく、プログラムに精通していない方でも簡単に利用できます。

様々なデータから情報を集約

データを一つ一つ取得する必要はなく、関連する情報を集めて表示します。
※ GGGenomeパッケージ版
高速に塩基配列を検索できるソフトウェア。設計した核酸医薬品のオフターゲット検索を高速かつ正確に実現します。
※ CRISPRdirectパッケージ版
CRISPR-CasシステムのガイドRNA設計ソフトウェアです。標的配列中のPAM配列を検索します。
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ここをクリックして表示したいテキストを入力してください。テキストは「右寄せ」「中央寄せ」「左寄せ」といった整列方向、「太字」「斜体」「下線」「取り消し線」、「文字サイズ」「文字色」「文字の背景色」など細かく編集することができます。
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安全性を考慮した設計が可能
設計と同時にオフターゲット効果を予測し、他の遺伝子に作用する可能性の低い部位を選択することができます。


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核酸医薬品設計時のお悩みを解決
 


データベースが
分散しており、
情報収集に時間がかかる

標的遺伝子の
配列比較・構造予測・
変異解析を個別ツールで
行う必要がある

配列設計の妥当性・
安全性を評価する
プロセスが煩雑

プログラミングが
大変・面倒
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ここをクリックして表示したいテキストを入力してください。
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